研究发现，在6492例NSCLC患者中，MTAP缺失发生率为10.4%，且在晚期患者中更为常见。与MTAP完整组相比，MTAP缺失组携带驱动基因变异的比例显著升高（72.4% vs 65.2%，P < 0.001），其中EGFR 19号外显子缺失、ALK融合及MET扩增等变异更为常见。

在4280例驱动基因阳性NSCLC患者中，491例（11.5%）存在MTAP缺失，其中87.8%表现为全基因缺失，部分缺失则主要累及第8外显子。

临床疗效方面，在173例接受一线靶向治疗的驱动基因阳性晚期NSCLC患者中，MTAP缺失组的客观缓解率（ORR）显著低于MTAP完整组（15.0% vs 55.6%，P<0.001），中位无进展生存期（PFS）明显缩短（11.5 vs 26.0个月，HR=3.31），中位总生存期（OS）亦显著下降（26.2 vs 49.3个月，HR=2.91）。

进一步联合分析显示，MTAP/CDKN2A双缺失患者的治疗应答及生存结局最差，且多变量分析证实其为独立不良预后因素。

值得关注的是，在113例接受第三代EGFR-TKI治疗的患者中，MTAP缺失与更差的临床结局显著相关。 MTAP缺失组的ORR仅为8.3%，明显低于MTAP完整组的55.4%（P<0.001）；中位PFS分别为10.6个月和26.6个月（HR=3.28），中位OS分别为26.2个月和43.3个月（HR=4.94）。

联合分析进一步发现，MTAP/CDKN2A共同缺失患者的PFS和OS最短，而仅CDKN2A缺失组与两者均完整组之间的生存差异未达到统计学显著性。多变量分析显示，共同缺失仍是独立的不良预后因素，提示整合MTAP与CDKN2A状态，有望进一步细化第三代EGFR-TKI治疗人群的风险分层。

此外，配对基因组分析发现，部分患者在第三代EGFR-TKI治疗后出现获得性MTAP缺失，提示其可能参与靶向治疗抵抗。考虑到MTAP缺失可产生针对PRMT5/MAT2A通路的潜在合成致死弱点，未来有望探索相关抑制剂与EGFR-TKI联合治疗的策略。

总体而言，该研究基于大规模中国真实世界队列，揭示了MTAP缺失在驱动基因阳性NSCLC中的重要预后价值，也为未来探索PRMT5或MAT2A抑制剂相关联合治疗提供了依据。相关结果仍需更大规模前瞻性研究及功能实验验证。