我国是肝癌高发大国，肝癌新发与死亡病例均占全球42%以上，严重威胁国民健康。为系统破解肝癌防治难题，2006年1月，吴孟超、王红阳、汤钊猷、顾健人、闻玉梅、杨胜利、郑树森七位院士联名向国务院呈报“集成式开展肝癌研究”报告，由此拉开国家肝癌科学中心建设序幕。

2009年8月，国家肝癌科学中心获国家发改委批复立项，是我国第二个国家级科学中心，坐落于上海市嘉定区安亭镇前炬路366号，占地面积45.6亩，建筑面积2.6万余平方米，配套科研楼宇、学术交流中心及SPF级标准实验动物屏障设施。

国家肝癌科学中心是海军军医大学“双一流”基础医学学科肿瘤生物学领域建设单位，承担国家教育部、军队和上海市重点实验室建设任务。在我国著名肿瘤生物学家、中国工程院院士、国家肝癌科学中心创始主任、学术主任王红阳院士的领衔建设下，国家肝癌科学中心瞄准“建设集聚、培育创新人才学科优势显著的一流国家科学中心”的目标，聚焦炎癌转化、肿瘤干细胞信号调控、肝胆肿瘤早期诊断等研究领域发起集成式冲锋，取得一系列重大科研成果，先后培养国家杰青5名、教育部长江学者4名以及大批青年科研骨干，以第一完成人获国家科技进步一等奖、创新团队奖、国家自然科学二等奖、上海市自然科学一等奖和军队科技进步一等奖等9项，王红阳院士本人获全国创新争先奖（奖章）、吴阶平医学奖、全国三八红旗手标兵、上海市“十大科技精英”等荣誉。

2026年10月，国家肝癌科学中心与海军军医大学第三附属医院（上海东方肝胆外科医院）全面融合发展。坚持临床出题、科研破题，打通基础研究与临床诊疗通道，围绕肝胆肿瘤早期诊断、发病机制、精准治疗协同攻关，促进科研成果向临床诊疗技术高效转化，汇聚人才合力，一体打造肝癌防治创新高地，不断提升肝胆肿瘤规范化、精准化诊疗水平，以院所合一初心助力再次腾飞。